Partizan je osnovan 4. oktobra 1945. godine u Beogradu, kao Fiskulturno društvo Centralnog doma Jugoslovenske armije. Među prvim klubovima koji su tada formirani bili su fudbalski, košarkaški, atletski, biciklistički i teniski klub. Društvo je 1950. godine reorganizovano i preraslo u sportsko društvo, a njegovi klubovi počeli su da okupljaju sportiste različitih uzrasta i van vojnih struktura.
Danas se istorija Partizana može posmatrati kroz rezultate njegovih brojnih klubova. JSD Partizan navodi da su njegovi klubovi tokom decenija osvojili više od 850 trofeja, među kojima su brojna državna prvenstva i kupovi, kao i 19 evropskih trofeja. Partizanovi sportisti osvojili su i 76 olimpijskih medalja.
Fudbalski klub Partizan jedan je od osnivača sportskog društva i klub koji je tokom istorije imao ogroman uticaj na jugoslovenski i srpski fudbal.
Prvu titulu prvaka Jugoslavije osvojio je već 1947. godine, a tokom narednih decenija postao jedan od najtrofejnijih klubova u zemlji.
Partizan je do danas osvojio 27 titula državnog prvaka, a 16 puta bio je osvajač nacionalnog kupa.
Najveći evropski uspeh u istoriji fudbalskog kluba dogodio se 1966. godine, kada je Partizan stigao do finala Kupa evropskih šampiona, današnje Lige šampiona. Crno-beli su tada u četvrtfinalu eliminisali prašku Spartu, a zatim u polufinalu francuski Nant i tako izborili svoje prvo i do danas jedino finale najjačeg evropskog klupskog takmičenja.
U finalu odigranom na stadionu Hejsel u Briselu, 11. maja 1966. godine, Partizan je poražen od Real Madrida rezultatom 2:1.
Dvanaest godina kasnije stigao je i jedan od retkih međunarodnih trofeja fudbalskog kluba. Partizan je 1978. godine osvojio Mitropa kup, takmičenje u kojem su nastupali najbolji klubovi srednje Evrope.
Najveći uspeh u istoriji kluba ostvaren je 1992. godine, kada je Partizan osvojio Kup evropskih šampiona. Ekipa predvođena mladim Željkom Obradovićem na klupi, sa Aleksandrom Đorđevićem i Predragom Danilovićem kao ključnim igračima, stigla je do samog vrha evropske košarke.
U finalu odigranom u Istanbulu, Partizan je savladao Huventud rezultatom 71:70, a utakmica je ostala upamćena po čuvenoj trojci Aleksandra Đorđevića u poslednjim sekundama meča.
To nije bio jedini evropski uspeh. Partizan je tri puta osvajao Kup Radivoja Koraća, a tokom godina je postao jedan od klubova sa najvećom tradicijom u evropskoj klupskoj košarci.
Posebno mesto zauzimaju i nastupi na fajnal-foru Evrolige. Partizan je 2010. godine u Parizu ponovo stigao među četiri najbolje evropske ekipe, gde je u polufinalu posle produžetka izgubio od Olimpijakosa, dok je u utakmici za treće mesto poražen od CSKA.
U novijoj istoriji crno-belih posebno se izdvajaju povratak u Evroligu 2022. godine, plasman u Plej of sa šeste pozicije i utakmice protiv Reala, gde je Partizan u Madridu slavio u prve dve utakmice i bio na korak od F4, a zatim izgubio 3, prvo dve u Beogradu, zatim jednu u Madridu.
Vaterpolo klub Partizan jedan je od najuspešnijih sportskih kolektiva u istoriji jugoslovenskog i srpskog sporta.
Crno-beli vaterpolisti osvojili su čak sedam titula prvaka Evrope. Prvi put su na evropski tron stigli još šezdesetih godina, kada je Partizan dominirao evropskim vaterpolom.
Pored sedam titula prvaka Evrope, Partizan je osvajao i Kup pobednika kupova, LEN kup i Superkup Evrope.
Generacije Partizanovih vaterpolista dale su veliki broj reprezentativaca Jugoslavije, Srbije i Crne Gore i Srbije, a klub je decenijama bio jedan od glavnih centara razvoja vrhunskog vaterpola.
Partizanova priča nije vezana samo za najpopularnije ekipne sportove.
Velike uspehe ostvarivali su i atletičari, rvači, karatisti, strelci, bokseri, džudisti, teniseri, biciklisti i sportisti iz brojnih drugih klubova sportskog društva.
Za 81 godinu postojanja promenile su se države, sistemi takmičenja, generacije igrača i trenera, ali je ostao prepoznatljiv crno-beli grb.